梅里埃VITEK采用傳統的比色法和快速熒光法。根據不同類別細菌的理化性質不同，設計不同的測試卡，每一張卡包括多項生化反應。儀器采用光電比色法測定細菌因分解底物導致PH值改變或由于細菌生長利用底物而引起的透光度變化；其熒光法是在測試卡的小孔中加入酶底物，使其與細菌產生的酶結合生成熒光物質。

 

　　細菌鑒定實驗底物有幾種不同類型，各個不同品牌的儀器均使用自己的測試卡和相應的試劑；以酶為基礎的反應底物，包括顯色底物和熒光底物；以微生物生長為基礎的底物是糖類底物和化合物底物，還有混合底物。

 

　　梅里埃VITEK通過與各種細菌發生氧化、降解及水解反應，產生顏色的變化或產生熒光物質，利用顯色和熒光強度的變化。來鑒定細菌的菌型。儀器會自動選擇底物進行分析。

 

　　DNA測序進行菌種鑒定的結果比傳統生化鑒定更為直接，鑒定結果也更為可靠。測序不依賴菌種本身特點，對所有菌種均可使用。對于細菌，對16SrRNA進行分析鑒定，對于真菌，對其ITS基因進行測序分析。利用特定引物PCR擴增未知菌株的16SrRNA基因或者ITS區，并進行DNA測序，與GenBank中的已知序列進行同源性比較后，判定細菌種類，將細菌劃分到屬或種。

 

　　微量生化鑒定系統，是在傳統生化試驗的基礎上加以改進，將原先用試管進行的系列生化反應，壓縮整合到一組含有供不同生化試驗用的脫水底物的小管組合的裝置內。試驗時將培養物制成菌懸液，分注于各個小管內，并在小管上加上礦物油。然后，用適宜的溫度培養一定時間。取出觀察各孔的顏色變化（少數試驗須于滴加試劑后判斷）。